Julien Martin comenzó sus estudios de flauta dulce en el Conservatorio de Angers. Se especializó en el Conservatorio Nacional Superior de Música de Lyon con Pierre Hamon y luego en el Conservatorio de Amsterdam (Walter van Hauwe) y la Scuola Civica da Milano (Pedro Memelsdorff).

Ha colaborado en numerosas ocasiones con el conjunto Capriccio Stravagante y el clavecinista Skip Sempé, realizando varias grabaciones discográficas para el sello Paradizo. Como solista, ha sido invitado por Helsinki Baroque Orchestra y B’Rock. Toca regularmente en música de cámara con los conjuntos Résonances y Sudestada. Ha participado también en producciones de orquesta y en numerosas grabaciones bajo la dirección de Gustav Leonhardt, Raphaël Pichon, René Jacobs, William Christie, Marc Minkowski, Hugo Reyne, Christina Pluhar, con Le Concert Français, Pygmalion, Le Cercle de l’Harmonie, Les Musiciens du Louvre, La Simphonie du Marais, L’Arpeggiata.

Es profesor de flauta dulce en el Conservatorio de Levallois-Perret.